Das International Co-Investigator Scheme ermöglicht die Finanzierung von grenzüberschreitenden Projekten, die ein Teilprojekt im Ausland umfassen. Der SNF oder eine Partnerorganisation evaluieren und finanzieren sowohl das Projekt als auch das Teilprojekt. Das International Co-Investigator Scheme ist Teil der Projektförderung. Für die ausländischen Mitgesuchstellenden gelten ebenfalls die Voraussetzungen aus Artikel 3 und 4 des Reglements über die Projektförderung, d. h. sie müssen im betreffenden Land über eine Mindestanstellung von 50 Prozent verfügen.