Diese JRPs ermöglichen es Forschenden in der Schweiz, zusammen mit Forschenden der Partnerländer, spezifische Forschungsfragen zu behandeln. Die Projekte dauern üblicherweise 3-4 Jahre. Es werden ähnliche Forschungskosten wie in der SNF-Projektförderung finanziert. Der SNF organisiert die Ausschreibungen gemeinsam mit einer Partnerorganisation im betreffenden Land. Die erfolgreichen Projekte werden von beiden Ländern gemeinsam unterstützt, wobei jede Organisation die Forschenden in ihrem eigenen Land finanziert. Die Ausschreibungen finden unregelmässig statt und sind häufig thematisch begrenzt, wobei die Themen aufgrund ihrer Relevanz für die beiden jeweils involvierten Länder ausgewählt werden.